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- Démarche intégrée pour l'obtention d'aliments de qualité
- Département Amélioration des méthodes pour l'innovation scientifique
- Département Cultures annuelles
- Département Cultures Pérennes
- Département des Cultures Annuelles
- Département Elevage et médecine vétérinaire
- Département Environnements et Sociétés
- Département Forêt
- Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux
- Département Productions fruitières et horticoles
- Département Systèmes Biologiques
- Département Territoires, Environnement et Acteurs
- Développement et amélioration des plantes
- Direction de l'innovation et de la communication de la Direction générale
- Direction du département Environnements et sociétés
- Direction du département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux
- Direction Générale Déléguée à la Recherche et à la Stratégie
- Direction générale déléguée aux ressources et aux dispositifs
- Direction régionale à Madagascar
- Direction régionale Antilles-Guyane
- Direction régionale Languedoc-Roussillon
- Direction Régionale Réunion Mayotte
- Diversité, adaptation, développement des plantes
- Diversité et adaptation des plantes cultivées
- Diversité et génomes des plantes cultivées
- Diversité génétique et amélioration des espèces forestières
- DP-Forêts et Biodiversité à Madagascar (Dispositif de Partenariat)
- DP-Hevea Research Platform in Partnership
- DP-Pôle Pastoralisme Zones Sèches (Dispositif de Partenariat)
- DP-Research Platform - Production and Conservation in Partnership-Production et conservation en partenariat en Afrique australe (Dispositif de Partenariat)
- Dynamique des forêts naturelles