Modélisation des dynamiques de maladies foliaires de cultures pérennes tropicales à différentes échelles spatiales : cas de la cercosporiose noire du bananier

Résumé : Cette thèse concerne la modélisation des dynamiques de maladies foliaires de cultures pérennes tropicales à différentes échelles spatiales. Cette approche de modélisation est appliquée à la cercosporiose noire du bananier. Il s'agit d'explorer et de déterminer les paramètres environnementaux et de résistance de l'hôte ayant une influence significative sur la dynamique spatio-temporelle de la maladie et d'apporter des éléments associés au contrôle de la cercosporiose noire. Deux modèles ont été développés dans le cadre de cette thèse. La dynamique épidémiologique au niveau de la plante est décrite par un modèle mécaniste décomposé en un module de croissance de la plante et un module épidémiologique décrivant le cycle épidémique du pathogène. Le modèle a été validé par un jeu de données indépendant. Les expérimentations numériques et l'analyse de sensibilité du modèle réalisées par les méthodes de Morris et de e-FAST ont permis de mieux comprendre le fonctionnement épidémique de cette maladie et d'identifier les paramètres influant le plus la dynamique épidémique en particulier la vitesse d'extension des lésions, la durée d'incubation et l'efficacité d'infection. L'approche bayésienne a permis d'affiner l'information a priori disponible pour ces trois paramètres. L'analyse de sensibilité du modèle a également permis d'identifier l'influence de deux paramètres liés à la croissance de la plante : le nombre de feuilles présentes sur une plante et le rythme d'émission foliaire. Un modèle de dynamique spatio-temporelle de la cercosporiose noire a été développé à l'échelle d'un territoire à partir d'enquêtes effectuées en Martinique (FWI) pendant la période d'invasion de cette maladie de septembre 2010 à mai 2012. Le modèle utilise la théorie de processus ponctuels pour décrire la dynamique de la maladie. Les données récoltées étant censurées, l'inférence des paramètres du modèle a été réalisée dans un cadre bayésien en utilisant un algorithme MCMC d'augmentation de données. Les résultats mettent en évidence l'impact des jardins privés et des parcelles de bananiers plantains dans la dynamique invasive de la cercosporiose noire. Le modèle et l'inférence développés permettent de reconstruire la dynamique spatio-temporelle de l'invasion en fonction de la couverture du paysage. Les deux modèles de dynamiques spatio-temporelles développés à deux échelles spatiales différentes ont permis d'acquérir des informations importantes pour construire des outils de conception de méthode de contrôle de la cercosporiose noire des bananiers.
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Thèse
Mathématiques [math]. Université des Antilles et de la Guyane, 2015. Français
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Contributeur : Clara Landry <>
Soumis le : jeudi 10 septembre 2015 - 17:29:00
Dernière modification le : mercredi 24 mai 2017 - 01:07:44
Document(s) archivé(s) le : lundi 28 décembre 2015 - 22:34:57

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Clara Landry. Modélisation des dynamiques de maladies foliaires de cultures pérennes tropicales à différentes échelles spatiales : cas de la cercosporiose noire du bananier. Mathématiques [math]. Université des Antilles et de la Guyane, 2015. Français. 〈tel-01172680〉

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